Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms