Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms