Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q08AU9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q08AU9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q08AU9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms