Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms