Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad51Q08297 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms