Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HgfQ08048 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HgfQ08048 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms