Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf9Q05BQ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf9Q05BQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf9Q05BQ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf9Q05BQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf9Q05BQ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf9Q05BQ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf9Q05BQ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms