Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fmn1Q05860 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms