Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms