Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1Q04750 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms