Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms