Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms