Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms