Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms