Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msx2Q03358 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms