Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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