Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms