Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms