Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp39Q02525 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms