Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ank1Q02357 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ank1Q02357 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms