Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RykQ01887 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RykQ01887 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RykQ01887 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RykQ01887 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RykQ01887 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms