Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2aQ01320 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2aQ01320 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms