Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf2raQ00941 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf2raQ00941 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms