Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms