Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms