Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms