Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms