Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shc1P98083 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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