Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr2cP97760 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms