Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tarbp2P97473 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms