Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bop1P97452 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms