Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms