Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms