Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx2P81066 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms