Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms