Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rit1P70426 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rit1P70426 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rit1P70426 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rit1P70426 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms