Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shox2P70390 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shox2P70390 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shox2P70390 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms