Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad50P70388 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rad50P70388 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad50P70388 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms