Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms