Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms