Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms