Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms