Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps27aP62983 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms