Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms