Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd2P62317 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd2P62317 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms