Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms