Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg6P61406 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms