Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms