Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms