Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms